コバエが大量発生するのを防ぐためには、孵化する前の卵の段階から駆除することが肝心です。
そして卵を産みつける場所は大体決まっているので、見つけたら放置するのではなくすぐに対処してしまいましょう。
有効的なのはすぐにゴミとして処分してしまうことですが、次のゴミの日を待っている間に成虫になってしまうほどコバエの成長速度は高いです。
そのため卵をビニール袋などで完全に密閉して、成虫になっても出てこれないようにする必要があります。
また卵の段階でも熱湯をかければ、中のコバエは死滅して生まれてくることができなくなります。
なので特に熱に弱いものに産みつけられているのでなければ、とりあえず熱湯をかけておくと良いでしょう。